D'abord centrée sur l'économie d'énergie et l'efficacité énergétique, qui reste au coeur de ses métiers et constituant son premier pôle, l'ATEE a progressivement pris en compte les enjeux environnementaux liés à l'énergie, la pollution atmosphérique puis l'effet de serre et le climat, avec la formation d'un deuxième pôle d'activités, tout aussi important que le premier et reposant sur le même principe de démarche technique.

Aujourd'hui, le premier pôle regroupe les activités relatives à l'efficacité énergétique dans les entreprises et les collectivités ainsi que les Clubs C2E (Certificats d'Economies d'Energie) et Cogénération, tandis que le second est tourné vers le support aux énergies renouvelables à travers les Clubs Biogaz, Stockage d'Energies, Power to Gas et Pyrogazéification mais aussi un groupe de travail sur les émissions liées à la combustion. 

Lieu d'information, de concertation et de propositions, l'ATEE est ouverte à tous les acteurs concernés par ces sujets, qu'ils soient des personnes morales ou physiques, privées ou publiques. L'ATEE dispose en outre de 13 délégations régionales, qui démultiplient l'action sur le terrain et permettent d'en faire remonter les préoccupations et les retours d'expérience.

L'ATEE compte 2200 adhérents et édite une revue bimensuelle d'information Energie Plus.

Interprofession du biogaz, le club Biogaz a été créé au sein de l'ATEE le 20 septembre 1999, par les pionniers de la filière.
Le Club Biogaz rassemble les principaux acteurs français concernés par le biogaz et la méthanisation :

• les bureaux d'études et sociétés prestataires de services qui conçoivent des unités de méthanisation ;
• les organismes publics et privés qui concourent au montage juridique et financier des unités de méthanisation ;
• les entreprises et organismes qui réalisent et construisent des unités de méthanisation ;
• les fournisseurs d'équipements de valorisation, d'épuration, de transport et de distribution du biogaz ;
• les exploitants d'unités de méthanisation ou d'équipements de biogaz ;
• les entreprises industrielles maîtres d'ouvrages ou fournisseurs d'intrants ;
• les fournisseurs d'énergie ;
• les collectivités territoriales, les syndicats intercommunaux gérant les déchets et le traitement des eaux usées ;
• les coopératives et exploitations agricoles ;
• les organismes impliqués dans la recherche, l'enseignement ou la formation ;
• les associations, les organismes impliqués dans l'accompagnement de projets, l'animation, l'information.

Début 2020, le Club Biogaz compte plus de 240 structures adhérentes.
L'objectif du Club Biogaz est de promouvoir le développement des différentes filières de production et de valorisation.
Cela passe par les actions suivantes :
• favoriser la mise en commun d'expériences, d'informations et de réflexions concernant la méthanisation et la valorisation du biogaz ;
• proposer des mesures et aménagements réglementaires propres à favoriser la méthanisation et la valorisation du biogaz ;
• participer aux concertations nationales et européennes et donner son avis sur les textes en préparation tant en France qu'à l'échelon européen, en s'appuyant sur les compétences et les expériences de ses membres ;
• faire des propositions sur les recherches et mises au point néces-saires à la mise en place et au développement de filières ;
• rédiger tous les documents, supports utiles à la diffusion des bonnes pratiques ;
• créer des colloques, des formations ou des visites de site